金沢大学がん進展制御研究所 細胞情報学研究分野

Cell Signaling and Informatics

　当研究室では、がん転移・休眠・薬剤耐性などのがん進展における分子メカニズムの解明と治療法開発を目的として、研究を行っています。特に、シグナル伝達ネットワーク解析とオミクス・データサイエンスを中心とした細胞情報学を通して、転移制圧に向けた基礎研究を行っています。いわゆるWET実験（細胞を用いた実験・動物実験・臨床検体を用いた実験）とDRY解析（バイオインフォマティクス・データサイエンス）の両方を実施できる人材の育成に注力しています。「DRY解析による仮説・モデルの提案」と「WET実験による実証」を実現し、トランスレーショナル研究およびリバース・トランスレーショナル研究の促進を行っています。

　"募集" 当研究室では、大学院生（修士・博士・医師（M.D.））を受け入れています。また、博士研究員は日本学術振興会などの外部雇用資金獲得を主として受け入れています。申請書作成から申請の手続きまでサポート致します。また、研究費獲得状況に応じて、特任研究員等の雇用も可能です。まずは中山までお気軽にご連絡ください。

　共同研究、企業共同研究の受け入れも随時行っておりますので、ご興味のある方は、中山までご連絡ください。

CONTACT: 13-1 Takara-machi, Kanazawa, Ishikawa, Japan. e-mail: jnakayama[at]staff.kanazawa-u.ac.jp

NEWS

  • 2026.4.1
    お知らせ
    金沢大学がん進展制御研究所に着任しました。細胞情報学研究分野にて、がん転移におけるシグナル伝達・オミクス解析を駆使し、転移・休眠の分子機構解明・新規治療法の開発を目指して研究を行っていきます。
  • 2026.3.27
    論文 / Publication【47】
    慶応義塾大学・東海大学など複数施設の共同研究成果がJournal of Extracellular Vesichles誌に掲載されました。細菌由来EVsの機能解析とがんとの関係性について明らかにしました。
  • 2026.3.25
    お知らせ
    愛媛大学プロテオインタラクトーム解析共同研究拠点　2026年度共同利用・共同研究課題に、中山が採択されました。
  • 2026.3.23
    お知らせ
    公益財団法人大阪対がん協会 2025年度がん研究助成奨励金、公益財団法人がん研究振興財団　令和7年度がん研究助成金Ⅰに明果瑠-安岡が採択されました。
  • 2026.2.27
    お知らせ
    2026年度 日本学術振興会科学研究費基金 基盤研究(B)（研究代表者：中山淳）、若手研究（研究代表者：明果瑠-安岡いるま）に採択されました。
  • 2026.2.6
    学会・受賞・セミナー
    関西医科大学 大学院講義・がんプロセミナーにて、中山が発表しました。
  • 2026.1.24
    論文 / Publication【46】
    国立がん研究センター研究所・東京慈恵会医科大学との共同研究成果がnpj Precision Oncology誌に掲載されました。肺扁平上皮がんと肺腺癌におけるCancer-associated Fibroblasts(CAFs)の多様性について、1細胞メタ解析を用いて明らかにしました。
  • 2026.1.21
    学会・受賞・セミナー
    第25回複雑生命系秩序懇談会定例会にて、中山が発表しました。
  • 2025.12.18
    論文 / Publication【45】
    関西医科大学との共同研究成果がInternational Journal of Molecular Sciences誌に掲載されました。卵巣がんのanoikis耐性および腹膜播種におけるRNF126の機能について明らかにしました。
  • 2025.12.3-5
    学会・受賞・セミナー
    第48回日本分子生物学会にて、明果瑠-安岡、堀口が発表しました。
  • 2025.11.14
    論文 / Publication【44】
    早稲田大学との共同研究成果がGenes to Cells誌に掲載されました。乳がん細胞におけるTIE1の機能と悪性化機構を明らかにしました。
  • 2025.11.8-9
    学会・受賞・セミナー
    第9回転移シグナル若手研究会にて、中山、明果瑠-安岡が発表しました。
  • 2025.10.27
    お知らせ
    サイトオープンしました。
  • 2025.9.25-27
    学会・受賞・セミナー
    第84回日本癌学会学術総会にて、中山、明果瑠-安岡が発表しました。
  • 2025.9.3-5
    学会・受賞・セミナー
    2025年文部科学省 学術変革領域研究 学術研究支援基盤形成 先端モデル動物支援プラットフォーム（AdAMS）若手支援技術講習会にて、中山、明果瑠-安岡が発表しました。中山(ベストプレゼンター賞 口頭発表）、明果瑠-安岡（ベストプレゼンター賞　ポスター賞、きっかり3分間トーク賞、ベストディスカッサー賞）を受賞しました！
  • 2025.9.1
    論文 / Publication【42, 43】
    愛媛大学、名古屋市立大学との共同研究成果がCancer Science誌に2報掲載されました。大腸がんにおけるKLHL5の機能解析と臨床における意義を明らかにしました。
  • 2025.7.2-4
    学会・受賞・セミナー
    第29回日本がん分子標的治療学会学術集会にて、中山が発表しました。
  • 2025.6.19-20
    学会・受賞・セミナー
    第34回日本がん転移学会学術集会・総会にて、中山、明果瑠-安岡が発表しました。
  • 2025.6.30
    論文 / Publication【41】
    東北大学との共同執筆した総説がCell Structure and Function誌に掲載されました。STINGバリアントの機能とヒトへの応用についての総説です。
  • 2025.6.30
    お知らせ
    2025年度が始まりました。明果瑠-安岡 いるま（学振PD）と堀口音葉(技術補助員)がグループに加わりました。

中山 淳 Jun Nakayama, Ph.D.

金沢大学がん進展制御研究所 細胞情報学研究分野 准教授

シグナル伝達解析とオミクス・データサイエンスを駆使し、がん転移・休眠の分子メカニズム解明と新たな治療法開発を目標に研究を行っています。

2026.4 - present
大阪国際がんセンター研究所 腫瘍増殖制御学部 研究員

多段階的な現象である転移のなかでも休眠現象に注目して研究を開始しました。休眠の再定義と分子メカニズムの理解を通して、休眠を制御する戦略の確立を目標として研究を行っています。

Menter 東山繁樹

2023.9 - 2026.3
国立がん研究センター研究所 細胞情報学分野 病態情報学ユニット
日本学術振興会特別研究員PD・特任研究員

がん臨床検体を用いた解析を中心として、がんの本態解明や治療標的の探索を行っていました。特に1細胞解析（Single-cell RNA-seq: scRNA-seq）や空間オミクス（Visium等)を用いた解析を行いました。独自の解析アルゴリズム構築も行い、新たな解析手法の開発も行っていました。1細胞レベルの解析から、乳がんの超早期不均一進化モデルや喫煙による発がんイベントを明らかにしました。

Menter 山本雄介

2020.4 - 2023.8
早稲田大学 理工学術院 助手・助教

in vivo selection法を用いた独自の高転移株樹立とその解析から、転移の分子メカニズム解明を行っていました。高転移株はがん細胞のサブタイプや樹立手法・移植手法によって特徴的な転移Signatureを有していることがわかりました。そのSignatureから新たな転移制御遺伝子を同定し、転移の治療標的となりうる遺伝子を見出しました。

Menter 仙波憲太郎

2017.4 - 2020.3

外部所属

2024年 - 2026年　関西医科大学 附属生命医学研究所 がん生物学部門　客員研究員

2023年 - 2026年　国立がん研究センター研究所 病態情報学ユニット　外来研究員

　　

受賞歴

2025年　文部科学省 学術変革領域研究「先端モデル動物支援プラットフォーム」2025年度若手支援技術講習会 ベストプレゼンター賞（口頭発表）

2025年　公益財団法人大阪成人病予防協会 令和6年度成人病医学研究顕彰

2024年　公益財団法人大阪対がん協会 2024年度がん研究助成奨励金

2024年　The American Physiological Society, APS Select Award in Physiological Genomics

2023年　公益財団法人大阪対がん協会 2023年度がん研究助成奨励金

2023年　日本がん転移学会　奨励賞

2022年　Top Cited Article Award 2020-2021 'Genes to Cells', WILEY

2018年　In vivoイメージングフォーラム2018 SPI大賞（最優秀賞）

2018年　文部科学省 新学術領域研究「先端モデル動物支援プラットフォーム」平成30年度若手支援技術講習会 ベストポスター賞

2017年　文部科学省 新学術領域研究「先端モデル動物支援プラットフォーム」平成29年度若手支援技術講習会 ベストトーク賞

2017年　第21回日本がん分子標的治療学会学術集会 ポスター賞

2016年　文部科学省 新学術領域研究「先端モデル動物支援プラットフォーム」平成28年度若手支援技術講習会 ベストポスター賞

　　

委員歴

2026年-Present　Cells, Special Issue "Interaction between DNA Damage Response and Anti-Cancer Immunity", Guest Editor

2025年-Present　沖縄分子腫瘍学研究交流会　監事

2024年-Present　日本がん転移学会　評議員

2024年-Present　PathPortどこでも病理ラボ 分科会 サポートメンバー

2024年-2025年　日本癌学会 若手共創ワーキンググループ メンバー

　　

助成金・競争的資金

2026年　日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(B)

2025年　公益財団法人 日本フィランソロピック財団 がん研究フロンティア基金

2024年　公益財団法人 千里ライフサイエンス振興財団 岸本基金研究助成

2024年　日本医療研究開発機構（AMED） 革新的がん医療実用化研究事業

2024年　公益財団法人 安田記念医学財団 若手癌研究助成

2024年　公益財団法人 持田記念医学薬学振興財団 2024年度持田記念研究助成金

2024年　公益財団法人 がん研究振興財団 がん研究助成事業

2023年　公益財団法人 武田科学振興財団 2023年度 医学系研究助成(がん領域(基礎))

2023年　日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(C)

2022年　公益財団法人 神澤医学研究振興財団 2022年度研究助成金

2022年　一般財団法人 横山臨床薬理研究助成基金 令和4年度研究助成金

2021年　グラクソ・スミスクラインジャパン 2021年度GSKジャパン研究助成

2021年　日本学術振興会 科学研究費助成事業 若手研究

2021年　公益財団法人 がん研究振興財団 がん研究助成事業

2021年　公益財団法人 東京生化学研究会 研究奨励金（Ⅰ）

2020年　日本学術振興会 科学研究費助成事業 特別研究員奨励費

2019年　早稲田大学 若手研究者支援事業アーリーバード

2018年　日本学術振興会 科学研究費助成事業 若手研究

　　

所属学会

日本がん転移学会, 日本癌学会, 日本分子生物学会, 日本がん分子標的治療学会, Metastasis Research Society

　　

学歴

2016.4 - 2019.3 早稲田大学大学院 先進理工学研究科 生命医科学専攻 博士後期課程　修了 博士（理学）

2014.4 - 2016.3 早稲田大学大学院 先進理工学研究科 生命医科学専攻 博士前期課程　修了 修士（理学）

2010.4 - 2014.3 早稲田大学 先進理工学部 生命医科学科　卒業 学士（理学）

Research Interests

Research overview

Metastasis

Signal Transduction and Omics analysis

　がん転移とは、がん細胞が原発巣から血液・リンパ液・腹水などに播種された後に遠隔臓器に生着し、増殖する現象です。転移が見つかると、臨床ではステージ4とみなされる段階であり、予後や治療方針に大きな影響を与えます。また多くの転移性腫瘍に対して有効な治療法がない現状です。がん転移は局所浸潤・血管リンパ管新生・循環系内での生存・遠位臓器への浸潤・微小転移の形成・転移コロニーの形成、という複数ステップで成立する非常に複雑な機構です。さらに、がん種によって転移しやすい臓器が異なり（指向性）、がん種や転移先臓器によって転移のメカニズムが異なることがわかっています。「どのがん」が「どの臓器」に「どの遺伝子を利用」して転移するのか、を理解することが、がん転移を制圧するうえで重要な課題となっています。がん転移は遺伝子変異などのゲノム異常だけで説明することは難しく、局所的な遺伝子発現変動やがん細胞の不均一性拡大などで転移能を獲得することがわかってきています。ゲノムだけでなく、様々な階層で理解することが重要になってきます。

　私達のグループでは、細胞内・細胞外・細胞間のシグナル伝達に着目して、がん細胞がどのようにして転移能を獲得するのかを明らかにすることを目的として研究しています。独自に樹立した高転移性のがん細胞株を用いた解析により、新たな転移制御遺伝子および治療標的遺伝子の探索を行っています。

Dormancy

　休眠とは、がん転移の過程や薬剤応答によって引き起こされる現象であり、分子レベルでの定義はまだ曖昧な現状です。現象論として、【1】可逆的なG0期に留まっており【2】代謝状態が落ちている状態で、数カ月から数十年という長い期間、その局所に留まっている状態を指します。特に乳がんにおいては、転移先臓器に播種したがん細胞の多くは休眠状態にあり、転移再発の主因である休眠現象の理解と克服は重要な課題の1つです。

　私達は独自のin vitro Dormant assayを用いて、乳がん細胞における休眠の評価と休眠誘導薬の探索を行っています。休眠を制御する重要なシグナル伝達経路を同定しており、薬剤による休眠制御が可能となってきました。同定した薬剤の中には、実際に臨床で用いられているものもあり、なかには投与の時期を変更することによって寛解期が延長することも報告されているものもあります。休眠を誘導する薬剤をベースとしたがん休眠療法の確立は、寛解期の延長に繋がり、がん患者およびがんサバイバーの健康寿命を延伸する、重要な転移制圧の戦略の1つになると考えています。

Data Science

Single-cell analysis and Artificial Intelligence

　現在の生命科学は、オミクス解析の発展に伴って膨大な情報を取り扱う情報科学的側面が強くなっています。さらに機械学習・Artificial Intelligence(AI)の発展から人間の目では判別できない差を見出すこと、大量のデータを処理することが可能になってきました。ゲノム情報だけでなく、各階層のオミクス情報、医療記録、画像データなどの膨大な生命科学データを解析することが求められています。

　私達は特に1細胞レベルの解析に着目して、データ収集および統合解析を行っています。一般的な解析手法を駆使しつつも、自分たちの研究目的に合わせて独自の解析手法を確立し、新たな知見を得ることを目的としています。さらに1細胞情報と臨床情報を組み合わせた"1細胞メタ解析"の技術基盤構築にも取り組んでいます。これまでの臨床情報を1細胞レベルで読み解くことで、疾患の原因となる細胞や遺伝子の同定を行います。公共データベース利活用基盤を構築することで、これまでに不可能だった大規模解析を実現し、Robustな解析を行うことを目的としています。またWETデータ×オミクスデータ×AIの適用を通して、医療応用を目指した新たな技術開発を行っています。

　私達の強みとして、「DRY解析による仮説・モデルの提案」と「WET実験による実証」を実施していることが挙げられます。臨床検体やオミクス解析の大部分は相関関係を見出すことを得意としますが、因果関係まではっきりしないことが多いです。実際に実験に落とし込むことで因果関係を証明することまで行うことが、研究体制として確立されています。

研究課題

1. がん転移の分子機構解明と治療標的の探索

2. 休眠の分子機構解明と休眠を制御するがん休眠療法の確立

3. ゲノム異常・遺伝子発現変化を基盤としたがん進化と不均一性獲得機構の解明

4. 日本人ゲノム・SNPs研究に基づいた日本人に最適ながん医療の創出

5. 公共データベース利活用基盤の構築とデータサイエンスを応用したがん包括的解析

現在進行中の研究テーマ

1. 大規模薬剤スクリーニングによる休眠制御薬の探索と分子メカニズムの解明

2. がん休眠細胞の形態解析と判別AIの開発

3. 1細胞RNA-seq解析および空間トランスクリプトーム解析によるがん転移メカニズムの解明

4. CRISPR screeningによる休眠制御遺伝子の探索

5. 細胞間伝達物質の網羅解析技術の開発とニッチ解析

6. 構造転写因子を介したがん幹細胞性のエピジェネティック制御と腫瘍内不均一性の解明

7. クローン選択に関わる遺伝子の探索と競合性の評価

8. データサイエンス手法を応用した新たな不均一性定量解析手法の開発

9. SNPs解析を通した免疫シグナル異常の解明と遺伝的背景の理解

10. 有機合成との融合研究による新規シーズ化合物の創製と抗がん/抗疼痛研究

11. TBD

Member

2025年度メンバー
Staffs

  • 中山 淳 #Jun Nakayama, Ph.D.

    Researchmap, Google Scholar, ORCID

    准教授

  • 明果瑠-安岡 いるま #Eilma Akter-Yasuoka, Ph.D.

    Researchmap

    日本学術振興会 特別研究員PD

  • 堀口 音葉 #Otoha Horiguchi

    大阪国際がんセンター 技術補助員/社会人大学院生

    　　

Students

  • TBD

    　　

Alumni

  • 西田 亮一 #Ryoichi Nishida, Ph.D.

    2024.3 - 2025.3 技術補助員(大阪国際がんセンター)

Publications

Articles & Reviews

48. Shoji T, Shinojima A, Kishimoto T, Sato K, Ikegami N, Yumoto E, Shindo R, Uchida Y, Kusumi S, Koga D, Yamamoto E, Hirano Y, Ogino R, Shibata H, Izawa K, Yasumi T, Sato R, Nakayama J, Higashiyama S, Hasegawa J, Kajiho H, Sasaki T, Kuchitsu Y*, Taguchi T*. CHMP4B is a lysosomal effector of PI(3,5)P2, facilitating ESCRT-mediated microautophagic degradation of STING. Nature Communications. in press. PubMed

47. Tsubaki S, Nashimoto S, Tanaka R, Tsutsuki H, Kato K, Nakayama J, Kimura K, Oshima K, Yamamoto Y, Okusaka T, Esaki M, Kawai N, Ota N, Yoshioka Y, Ochiya T, Saito Y, Sawa T, Hozumi K, Matsuzaki J*, Tsugawa H*. Gut commensal Klebsiella pneumoniae extracellular vesicles shape a liver microenvironment conducive to gut-liver bacterial translocation and pro-tumorigenic processes. Journal of Extracellular Vesicles. 15(4):e70262. PubMed

46. Hirano Y, Suzuki H, Nakayama J, Yamamoto T, Hirata E, Araya J, Fujita Y*, Yamamoto Y*. An integrated single-cell lung cancer atlas reveals distinct fibroblast phenotypes between adenocarcinoma and squamous cell carcinomas. npj Precision Oncology. 2026 Jan 23. PubMed

45. Vu DA†, Mori S†, Akamatsu K, Nakayama J, Sakamoto T*. Ring-finger protein 126 (RNF126) promotes anoikis resistance and peritoneal dissemination in ovarian cancer. International Journal of Molecular Sciences. 2025;26(24):12183. PubMed

44. Azuma K, Matsuyama T, Watanabe S, Semba K*, Nakayama J*. TIE1 promotes primary tumor growth by inhibiting apoptosis and activating AKT-p70S6K signaling pathway in breast cancer. Genes to Cells. 2025 Nov;30(6):e70062. *Corresponding Author. PubMed

43. Habu K, Matsuoka Y, Hiyoshi H, Nakayama J, Watanabe K, Tate S, Sakaue T, Murai J, Uno K, Nishie H, Kubota E, Kataoka H, Joh T, Watanabe Y, Oshikiri T, Higashiyama S*. KLHL5 Contributes to Colorectal Cancer Cell Survival by Promoting Cell Cycle Progression and Suppressing Apoptotic Cell Death. Cancer Science. 2025 Sep;116(9):2444-2456. PubMed

42. Uno K, Nishie H, Hiyoshi H, Habu K, Nakayama J, Tate S, Sakaue T, Kubota E*, Tanaka M, Shimura T, Kataoka H, Joh T, Higashiyama S. Implication of KLHL Gene Family Member KLHL5 in Colorectal Cancer Progression and Prognosis. Cancer Science. 2025 Sep;116(9):2580-2591. PubMed

41. Koide S†, Yumoto E†, Nakayama J, Higashiyama S, Kuchitsu Y*, Taguchi T*. Cell biological insights into human STING variants. Cell Structure and Function. 2025 Jun 7;50(1):135-144. Review. PubMed

40. Yoshida K, Yokoi A*, Suzuki H, Tamauchi S, Kitagawa M, Inami E, Nakayama J, Mori Y, Okamoto K, Suzuki Y, Yoshida H, Kato T, Kajiyama H, Yamamoto Y*. Single-Nucleus RNA Sequencing and Spatial Transcriptomics for Squamous Cell Carcinoma Arising From Ovarian Mature Teratoma. Cancer Science. 2025 May;116(5):1339-1351. PubMed

39. Weisheng Z, Nakayama J, Inomata Y, Higashiyama S, Hiratsuka T*. A sensitive ERK fluorescent probe reveals the significance of minimal EGF-induced transcription. Cell Structure and Function. 2025 Feb 7;50(1):15-24. PubMed

38. Nakamichi K, Suzuki H, Yamamoto Y, Semba K, Nakayama J*. Nuclear receptor profiling for subtype classification and as prognostic markers in 33 cancer types. Discover Oncology. 2024 Dec 24;15(1):834. *Corresponding Author. PubMed

37. Murayama T, Mahadevan NR, Meador CB, Ivanova EV, Pan Y, Knelson EH, Tani T, Nakayama J, Ma X, Thai TC, Hung YP, Kim W, Watanabe H, Cai KQ, Hata AN, Paweletz CP, Barbie DA, Cañadas I*. Targeting TREX1 Induces Innate Immune Response in Drug-Resistant Small-Cell Lung Cancer. Cancer Research Communicantions. 2024 Sep 1;4(9):2399-2414. PubMed

36. Yamamoto T†, Nakayama J†, Urabe F, Ito K, Nishida-Aoki N, Kitagawa M, Yokoi A, Kuroda M, Hattori Y, Yamamoto Y, Ochiya T. Aberrant regulation of serine metabolism drives extracellular vesicle release and cancer progression. Cell Reports. 2024 Aug 27;43(8):114517. †Contributed Equally. PubMed

35. Kuroiwa Y*, Ito K, Nakayama J, Semba K, Yamamoto Y*. Analysis of the responsiveness to antiandrogens in multiple breast cancer cell lines. Genes to Cells. 2024 Apr;29(4):301-315. PubMed

34. Murayama T, Nakayama J, Jiang X, Miyata K, Morris AD, Cai KQ, Prasad RM, Ma X, Efimov A, Belani N, Gerstein ER, Tan Y, Zhou Y, Kim W, Maruyama R, Campbell KS, Chen L, Yang Y, Balachandran S, Cañadas I*. Targeting DHX9 Triggers Tumor-Intrinsic Interferon Response and Replication Stress in Small Cell Lung Cancer. Cancer Discovery. 2024 Mar 1;14(3):468-491. PubMed

33. Ishibashi K, Ichinose T, Kadokawa R, Mizutani R, Iwabuchi S, Togi S, Ura H, Tange S, Shinjo K, Nakayama J, Nanjo S, Niida Y, Kondo Y, Hashimoto S, Sahai E, Yano S, Nakada M, Hirata E*. Astrocyte-induced mGluR1 activates human lung cancer brain metastasis via glutamate-dependent stabilization of EGFR. Developmental Cell. 2024 Mar 11;59(5):579-594.e6. PubMed

32. Nakamichi K, Yamamoto Y, Semba K*, Nakayama J*. Metastatic potentials classified with hypoxia-inducible factor 1 downstream genes in pan-cancer cell lines. Genes to Cells. 2024 Feb;29(2):169-177. *Corresponding Author. PubMed

31. Yamaguchi K†, Nakayama J†*, Yamamoto T†, Semba K, Shirota T, Yamamoto Y*. Collagen induction of immune cells in the mammary glands during pregnancy. Physiological Genomics. 2024 Feb 1;56(2):128-135. *Corresponding Author, †Contributed Equally. PubMed APS Select Award in Physiological Genomics.

30. Inoue C, Mukai K, Matsudaira T, Nakayama J, Kono N, Aoki J, Arai H, Uchida Y*, Taguchi T*. PPP1R12A is a recycling endosomal phosphatase that facilitates YAP activation. Scientific Reports. 2023 Nov 13;13(1):19740. PubMed

29. Nakayama J*, Yamamoto Y*. Cancer-prone Phenotypes and Gene Expression Heterogeneity at Single-cell Resolution in Cigarette-smoking Lungs. Cancer Research Communicantions. 2023 Nov 10;3(11):2280-2291. *Corresponding Author. PubMed

28. Yokoi A*, Yoshida K, Koga H, Kitagawa M, Nagao Y, Iida M, Kawaguchi S, Zhang M, Nakayama J, Yamamoto Y, Baba Y, Kajiyama H, Yasui T*. Spatial exosome analysis using cellulose nanofiber sheets reveals the location heterogeneity of extracellular vesicles. Nature Communications. 2023 Nov 8;14(1):6915. PubMed

27. Ito K, Yamamoto T, Hayashi Y, Sato S, Nakayama J, Urabe F, Shimasaki T, Nakamura E, Matui Y, Fujimoto H, Kimura T, Egawa S, Ochiya T*, Yamamoto Y*. Osteoblast-derived extracellular vesicles exert osteoblastic and tumor-suppressive functions via SERPINA3 and LCN2 in prostate cancer. Molecular Oncology. 2023 Oct;17(10):2147-2167. PubMed

26. Shiino S*, Tokura M, Nakayama J, Yoshida M, Suto A, Yamamoto Y*. Investigation of Tumor Heterogeneity Using Integrated Single-Cell RNA Sequence Analysis to Focus on Genes Related to Breast Cancer-, EMT-, CSC-, and Metastasis-Related Markers in Patients with HER2-Positive Breast Cancer. Cells. 2023 Sep 15;12(18). PubMed

25. Han Y*, Katayama S, Futakuchi M, Nakamichi K, Wakabayashi Y, Sakamoto M, Nakayama J*, Semba K*. Targeting c-Jun Is a Potential Therapy for Luminal Breast Cancer Bone Metastasis. Molecular Cancer Research. 2023 Sep 1;21(9):908-921. *Corresponding Author. PubMed

24. Yoshida K, Yokoi A*, Kitagawa M, Sugiyama M, Yamamoto T, Nakayama J, Yoshida H, Kato T, Kajiyama H, Yamamoto Y*. Downregulation of miR‑10b‑5p facilitates the proliferation of uterine leiomyosarcoma cells: A microRNA sequencing‑based approach. Oncology Reports. 2023 May;49(5). PubMed

23. Hayashi Y, Nakayama J*, Yamamoto M, Maekawa M, Watanabe S, Higashiyama S, Inoue JI, Yamamoto Y, Semba K*. Aberrant accumulation of NIK promotes tumor growth by dysregulating translation and post-translational modifications in breast cancer. Cancer Cell International. 2023 Apr 1;23(1):57. *Corresponding Author. PubMed

22. Azuma K, Sakamoto M, Katayama S, Matsui A, Nakamichi K, Goshima N, Watanabe S, Nakayama J*, Semba K*. HOXB7 induces STAT3-mediated transformation and lung metastasis in immortalized mammary gland NMuMG cells. Genes to Cells. 2023 Apr;28(4):277-287. PubMed

21. Watanabe N†, Fujita Y†*, Nakayama J†, Mori Y, Kadota T, Hayashi Y, Shimomura I, Ohtsuka T, Okamoto K, Araya J, Kuwano K, Yamamoto Y*. Anomalous Epithelial Variations and Ectopic Inflammatory Response in Chronic Obstructive Pulmonary Disease. American Journal of Respiratory Cell and Molecular Biology. 2022 Dec;67(6):708-719. †Contributed Equally. PubMed

20. Tokura M†, Nakayama J†, Prieto-Vila M, Shiino S, Yoshida M, Yamamoto T, Watanabe N, Takayama S, Suzuki Y, Okamoto K, Ochiya T, Kohno T, Yatabe Y, Suto A, Yamamoto Y*. Single-Cell Transcriptome Profiling Reveals Intratumoral Heterogeneity and Molecular Features of Ductal Carcinoma In Situ. Cancer Research. 2022 Sep 16;82(18):3236-3248. †Contributed Equally. PubMed

19. Nakayama J*, Matsunaga H, Arikawa K, Yoda T, Hosokawa M, Takeyama H, Yamamoto Y, Semba K*. Identification of two cancer stem cell-like populations in triple-negative breast cancer xenografts. Disease Models & Mechanisms. 2022 Jun 1;15(6). *Corresponding Author. PubMed

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Books

2. 実験医学別冊 論文に出る遺伝子 デルジーン300 PubMed論文の登場回数順にヒト遺伝子のエッセンスを一望, 中山 淳 (担当:分担執筆), 羊土社 2024年12月 (ISBN: 9784758122771).

1. 実験医学別冊 RNA-Seqデータ解析 : WETラボのための超鉄板レシピ : ヒトから非モデル生物まで公共データの活用も充実, 中山 淳, 山本 雄介 (担当:分担執筆, 範囲:コラム バルク解析とシングルセル解析), 羊土社 2023年10月 (ISBN: 9784758122672).